26 октября 1864 года Третья харьковская гимназия оформилась как самостоятельное учебное заведение. Для неё был построен комплекс из трёх зданий по проекту архитектора Ивана-Эмилия Гинша. В новом комплексе разместились семь классов, к которым позже добавился восьмой.
К концу XIX века комплекс был выкуплен Министерством народного просвещения Российской империи. В здании была организована церковь, созданы помещения для учебных и административных нужд.
Архитектура
Комплекс Третьей мужской гимназии занимает участок площадью более трех тысяч квадратных метров и включает несколько зданий, окружающих небольшой внутренний двор. Архитектурный стиль фасадов сочетает элементы романского и готического стилей, трансформированных в украинское барокко. Здания выделяются орнаментированными пилястрами, коробовыми арками и декоративными элементами, создавая уникальный архитектурный облик.
12 Июля 1867г — Об учреждении Александровской стипендии в 3-й Харьковской гимназии.
Педагогический совет 3-й Харьковской гимназии, в знак спасения драгоценной жизни Государя Императора 25 мая этого года, открыл среди сотрудников, учителей и учеников этой гимназии сбор средств, который уже собрал 259 рублей 45 копеек и будет продолжаться. Собранный капитал предполагается вложить на вечные времена в местный городской общественный банк, чтобы проценты с капитала использовать ежегодно для стипендии одному из самых успешных учеников этой гимназии, как по поведению, так и по особому трудолюбию и успеваемости, выбор стипендиата будет предоставлен педагогическому совету. Вместе с тем совет попросил о ходатайстве назвать стипендию «Александровской», в честь Августейшего Имени Его Императорского Величества.
По всеподданнейшему докладу Министра Народного Просвещения, Его Императорское Величество, Высочайше одобрив учреждение при Харьковской 3-й гимназии одной стипендии на вышеуказанных основаниях, Всемилостивейше велел объявить жертвователям Высочайшую благодарность Его Величества.